Sebelum melakukan pembubaran, Kapolresta Banyumas Kombes Pol Whisnu Caraka SIk sempat melakukan diskusi terhadap sejumlah perwakilan mahasiswa. Namun, diskusi tersebut menemui jalur buntu. Hingga akhirnya sejumlah anggota Brimob dan kendaraan water cannon, dikerahkan guna membubarkan massa.
Massa yang di tembakan air dari kendaraan water cannon, secara perlahan membubarkan diri. Anggota Brimob pun maju untuk membubarkan massa serta menembakan belasan gas air mata. Massa sempat melakukan perlawanan dengan melemparkan sejumlah botol air. Namun, perlawanan mereka tidak bertahan lama. Dimana massa pergi meninggalkan depan Sipanji Purwokerto ke sisi Barat Alun-alun Purwokerto.
Sekitar pukul 20.15 WIB, seluruh mahasiwa berhasil dibubarkan. Sedangkan aparat kepolisian masih berjaga-jaga di halaman Pendopo Sipanji Purwokerto.
